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제33차 YPRC 프로테오믹스 워크샵 개최

작성자
KHUPO
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33rd YPRC Proteomics Workshop 



2006 1월 세계인간프로테옴 기구 (HUPO) Education & Training Center (Asia 지역 총괄)로 선정되었고, 염색체기반-인간단백질지도사업(C-HPP, Paik et al., Nature Biotechnol., 2012)의 총괄본부인 연세프로테옴연구원에서는 제 33차 프로테오믹스 워크샵을 2012820일부터 24일까지 5일간 진행합니다.

본 워크샵은 2-DE non 2-DE의 다양한 proteomics 실험기법 및 분석방법 교육뿐 만 아니라, 실제 실험과정에서 겪을 수 있는 문제점의 실무적인 해결책을 제공하는 것에 보다 큰 목적을 두고 있습니다. 2-DE 이미지에 가장 중요한 샘플의 전처리 과정, pH focusing 2D running 과정, 2-DE 이미지 분석 과정, MS MS/MS 데이터를 이용하여 단백질 동정결과를 얻는 과정에서 발생 가능한 문제점에 대해 연세프로테옴연구원의 해결 노하우 등을 제시함으로써, 2-DE 시스템을 새로 구축하시거나 참가자의 2-DE 이미지에서 향상된 결과를 얻으실 수 있도록 최선의 도움을 드림으로써 국내 프로테오믹스 분야의 질적 향상을 꾀하고자 합니다. 또한, MCP, JPR Proteomics 등 주요 프로테오믹스 관련 논문의 게재에 필요한 최소 guideline에 대한 대처 방법 등 실질적인 부분에서 해당 분야 연구자들께 도움을 드리고자 합니다.


지난 10년간 총 32차에 걸쳐 축적된 교육 노하우를 바탕으로, 10 단계의 실험과정 및 강의가 진행될 예정입니다. Lab 과정에서는 수강자 본인의 샘플에 대한 2-DE 분석 전 과정을 전문가의 도움하에 직접 실시하게 되며, 강의과정을 통해서 proteomics분석 방법의 이론적 배경 및 문제점의 해결 방법을 교육받으실 수 있습니다. 2-DE 응용분야인 Narrow pH range 2-DE와 형광 2-D DIGE 분석에 대한 내용을 들으시고, PTM(acetylation, glycosylation, phosphorylation) 연구를 위한 non-2DE 기반 장비들인 LC-MS/MS, PF2D, iTRAQ 분석에 대한 소개와 demo 실험을 통해, non-2DE 기법에 대한 응용 가능성을 미리 검토하시기 바랍니다.


2-DE
프로테옴 분석에서 가장 중요한 과정 중의 하나인 2-DE image 분석을 위하여, Melanie 분석 프로그램을 개인별로 할당하여, 직접 프로그램을 사용하면서 결과를 도출할 수 있는 교육을 받으시도록 하였습니다.

심도 있는 Proteome informatics session에는, MS, MS/MS spectrum 및 PTM 분석 결과를 이해하고, 활용하는 데에 필수적인 다양한 informatics tool에 대한 교육을 실시합니다.


워크샵 안내

 

1) 장소 및 일시 : 연세대학교 산학협동관 3310호 강의실, 4416호 실험실

2012년 820 () ~ 824 (), 5 일간

 

2) 장소: 연세대학교 연세프로테옴연구원 (YPRC)

► 후원: 보건복지가족부 지정 차세대 유전체 사업 악성종양단백체 센터 (CPRC)

 

3) 정원: 14명 이내

 

4) 참가비: YPRC, 차세대 유전체사업 참여 연구원- 110만원, 일반- 130만원

 

5) 참가자에게 제공되는 혜택 (사정에 따라 변경 가능)

1. 강의교재 (강의 내용, 실험절차 모음 및 강의용 유인물 자료 등)

2. 본인 샘플 2-DE 분석기회 제공 (paired sample: control vs. disease)

3. 수료증, 실험가운, USB 메모리

4. 워크샵 기간 중 중식, 무료 주차

 

6) 강사진
1. 백융기 교수(HUPO 회장, Proteomics 저널 Senior Editor, BMC Cancer Editorial Board)

2. 강의와 실험 조교

YPRC/BPRC 연구원- 이형주 박사 (LC-MS/MS), 정슬기 박사 (Proteome Informatics),

나근 박사 (2-DE, 2-D DIGE),

김혜영/강민정 연구원 (Sample preparation, 2-DE),

이선희 연구원 (2D image analysis),

최은영 연구원 (In-gel digestion for MS),

임종선 연구원 (MALDI-TOF-MS),

차현정 연구원 (LC-MS/MS)

 

7) 참가신청요령
  
첨부한 신청양식을 작성하셔서, 아래의 e-mail 주소로 신청서를 보내주시기 바랍니다.

o 담당자 : 나근 nak@proteomix.org (02-2123-6625, 010-5316-8264)

o 참가비 입금 및 영수증 발급, 샘플 준비 방법: 신청서를 받고 나서 개별 
        안내합니다.



* 자세한 내용은 첨부파일을 참고하시기 바랍니다.

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