20th YPRC/BPRC Proteomics Workshop
Protein Microarray
안내의 말씀
연세프로테옴연구센터 (YPRC)에서는 20차 프로테오믹스 워크샵으로 Protein microarray를 이용한 Protein-protein interaction wet workshop을 2006년 9월 28일 (목) 하루 코스로 개최합니다.
Protein microarray workshop 중점 추진방향
이번 워크샵은 첨단의 기능성 단백질발현시스템과 고집적 microarray technology의 융합체라 할 수 있는 protein microarray (Invitrogen, 이하 ProtoArray)를 활용하여 protein microarray에 대한 이론적 배경과 직접적인 실험실습을 통한 활용기회를 연구자 여러분들께 제공함으로써 protein-protein interaction, small molecule target identification, kinase substrate identification 등 최근의 생명과학 및 제약산업 연구분야에서 중요하게 인식되는 연구요소들을 획기적이고 효율적으로 탐색, 분석할 수 있는 새로운 tool을 소개하고자 합니다.
ProtoArray 소개
ProtoArray는 기존의 antibody나 peptide chip이 아니며 full-length functional protein이 올려져 있는 protein chip입니다. 탑재된 protein의 종류에 따라 human 과 yeast의 두 가지 종류가 있으며, 칩 version에 따라 1,800 ~ 5,000여 개의 functional protein이 심어져 있습니다. 또한 응용성에 따라 protein-protein interaction identification, small molecule-interacting protein identification, lipid-interacting protein identification, kinase substrate identification, antibody-specific profiling, immune response profiling 등 기초생명과학 연구, 제약산업 및 임상 진단용 도구로써 활용이 가능하며, 수천 종류의 단백질들을 대상으로 불과 수시간만에 연구자가 원하는 결과를 도출할 수 있습니다.
워크샵 개요
본 워크샵은 하루에 걸쳐 3 차례의 이론 강의와 6 단계의 실험실습과정으로 구성되어 있으며 참가자 전원이 실험실습에 직접 참여하는 방식으로 진행될 예정입니다 (Schedule 참조). 특히 참가자께서 자신의 샘플을 준비해 오셔서 본 실험실습을 통해 직접 연구결과를 도출해 내실 수 `있도록 특별한 기회를 제공해 드리고자 합니다. 샘플 준비를 위한 상세한 사항은 “참가자의 샘플준비” 부분을 참조하시기 바랍니다.
Fluorescence image 및 데이터 분석
ScanArray Gx (Perkin Elmer) 스캐너를 이용하여 각 실험샘플의 형광이미지를 얻으시고, 얻어진 이미지파일은 ProScanArray Express 3.0 프로그램을 통해서 사용법을 들으시면서 직접 본인의 샘플에 대한 결과를 분석해 보실 수 있습니다. Score의 조절을 통해 강한 affinity를 가진 protein만 선별할 수도 있으며, 혹은 약한 affinity까지 포함된 결합 단백질들을 모두 선별할 수도 있습니다. 1인 1 PC를 구비하여 참가자께서 데이터 분석과정을 직접 수행하실 수 있도록 하였습니다.
워크샵 참가 특전
참가자 정원
교육과정의 원활한 진행과 참석자들의 실질적 실험기회를 제공하고자 부득이 본 워크샵의 정원을 8명으로 한정하였으며 선착순으로 결정됩니다.
참가자의 샘플준비
본 워크샵에 참가하시는 분들께 본인의 희망에 따라 자신의 연구재료를 직접 실험하실 수 있는 기회를 제공해 드립니다. 단 실험실습과정상의 제한으로 인해 참가자가 할 수 있는 실험은 다음과 같습니다.
2006. 08.
연세프로테옴연구센터 (http://www.proteomix.org) 소장 백 융 기
워크샵 안내
참가신청요령 및 등록마감일
Protein Microarray Workshop 일정 (2006년 9월 28일)
본 일정은 사정에 따라 변경될 수 있습니다.
08:40 ~ 09:00 | Registration, Coffee & Tea |
09:00 ~ 09:10 | Opening remark (Young-Ki Paik, Ph D) |
09:10 ~ 09:40 | [Lecture] Why protein microarray? (Ho Jeong Kwon, Ph D) |
09:50 ~ 10:10 | [Experiment] Chip blocking |
10:10 ~ 10:30 | Coffee break |
10:30 ~ 11:10 | [Lecture] Accelerating Discovery Research and Drug Development with High Density, Functional ProtoArray[TM] Protein Microarrays (Gregory A. Michaud, Ph.D) |
11:20 ~ 11:50 | [Experiment] Probe dilution and hybridization |
12:00 ~ 13:00 | Lunch |
13:00 ~ 13:30 | [Experiment] Washing and fluorescence probe hybridization |
13:30 ~ 14:00 | [Lecture] Examples of ProtoArray experiments |
14:10 ~ 15:00 | [Experiment] Washing and drying chips |
14:40 ~ 15:00 | Coffee break |
15:00 ~ 16:00 | [Experiment/lecture] Scanning and data acquisition |
16:00 ~ 17:00 | [Experiment/lecture] Data analysis |
17:00 ~ 18:00 | Discussion and Closing remark |
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