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제11차 YPRC/BPRC Proteomics Workshop

작성자
KHUPO
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192
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The The 11th YPRC/BPRC Proteomics Workshop

"Integrated Advanced Proteomics Course at YPRC / BPRC"

------------------------------------------------------------------ Non 2DE의 활용성 제고


연세프로테옴연구센터 / 질병유전단백체연구지원센터에서는 2004년 7월 19일부터 23일까지 보건복지부 지정 유전체연구센터 소속 연구원 및 일반 연구원을 대상으로, 2DE 및 non 2DE의 다양한 proteomics 실험기법 및 분석방법을 소개하고 이분들에게 교육훈련기회를 부여하기 위하여 다음과 같이 정규 코스 워크샵을 실시합니다.

특히 이번 11차 워크샵에서는 YPRC / BPRC의 새로운 non 2DE 장비들인 Nanoflow proteomics solution (Agilent), Free Flow Electrophoresis (Tecan), Proteomelab PF2D (Beckman)에 대한 introduction과 다양한 application 소개 및 demonstration을 하게 됩니다. 이를 통하여 2DE의 여러 단점들을 극복할 수 있는 non 2DE 장비의 활용성 극대화의 기회를 가지실 수 있으리라 판단됩니다.

또한, 2DE 프로테옴 분석에서 가장 중요한 과정 중의 하나인 image 분석을 위하여 Image Master Platinum 5.0 (Melanie 4)에 대한 1인 1 PC를 할당, 교육하여 가장 강력한 통계분석툴을 보유한 해당 소프트웨어를 이용하실 수 있도록 충분한 기회를 제공하여 드릴 것입니다.

교육과정의 원활한 진행과 참석자들의 실질적 실험기회를 제공하고자 부득이 본 워크샵의 정원을 15명 내외로 한정하였으며, 신청자가 이보다 많을 경우에는 소정의 절차에 따라 참석자를 결정하게 됨을 양해하여 주시기 바랍니다.

  1. 일시: 2004년 7월 19일 ~ 7월 23일 (5 일간)
  2. 장소 및 주관기관: 연세대학교 연세프로테옴연구센터
  3. 후원: 보건복지부 지정 질병유전단백체연구지원센터, Agilent Korea Ltd., KDR, 그린메이트 (Tecan), 동영과학 (Beckman), Amersham Bioscience Korea, GeneBio (Swiss), CureBio, KTF, 한국인간프로테옴기구 (KHUPO), 연세대특성화BT연구단,
  4. 강사진

    1. 백융기 교수 (연세프로테옴연구센터 소장, HUPO 사무총장, HLPP/HPPP Executive Committee Member (집행위원))

    2. 조상연 연구교수 (연세프로테옴연구센터/질병유전단백체연구지원센터 연구지원실장)

    3. 유종신 박사 (기초과학지원연구원 선임부장)

  5. 조교진: YPRC 연구원 (이은영 (FFE), 권민석 (Proteome Database)), BPRC 전임연구원 (전영욱 (MALDI), 이준석 (LC-MS/MS), 김혜영 (2DE), 이형주 (PF2D))
  6. 정원: 15명 이내
  7. 참가비: 1) 유전체연구센터 참여 연구원 90만원, 2) 일반: 110만원
  8. 참가자에게 제공되는 혜택 (사정에 따라 변경 가능)
1) 강의교재 (강의 내용, 실험절차 모음 및 슬라이드 유인물 자료 등)
2) 본인 샘플 분석기회 제공 (2DE + MALDI)
3) 수료증
4) 워크샾 기간 중 중식
5) 전자저널 이용 및 Print 서비스 (프로테오믹스 관련)
6) 워크샾 기간 중 주차 무료

참가신청요령 및 등록마감일

첨부한 신청양식을 다운로드 받으신 후, 아래의 e-mail 주소로 신청서를 보내주시기 바랍니다.

o 담당자 (이미연): mylee@proteomix.org, 02-2123-3279)

  • 신청마감일 : 2004년 6월 30일 (수요일) 오후 5시 까지
  • 신청자가 수강예정인원보다 많을 경우에는 센터 소정의 절차에 따라 수강예정자를 선정함.
  • 선정된 일반 수강예정자는 개별 통지 예정 (7월 첫째주 예정)

[ 신청서 다운로드 ]


Workshop 일정
(* 본 일정은 사정에 따라 예고 없이 변경될 수 있습니다)

Day 1
Monday, Jul 19, 2004
09:00 Registration, Coffee & Tea
09:30 [Lecture 1] Introduction to Recent Trends in Proteomics (Sang Yun Cho, Ph.D.)
10:20 [Lecture 2] Sample Preparation for 2DE and non 2DE (Sang Yun Cho, Ph.D.)
11:00 [Lab 1]IEF/1D Sample Preparation (Amersham Bioscience's IPGphorTM[In-gel rehydration] and MULTIphorTM [Cup loading]
13:00 Lunch
14:30 [Lab 2] Gel Casting (Gradient gel preparation)
16:30 [Demonstration] Free Flow Electrophoresis (TECAN/Eun Young Lee)
17:30 End
Day 2
Tuesday, Jul 20, 2004
09:00 Coffee & Tea, Refreshment
09:30 [Lab 3] Equilibration and 2DE Analysis of Samples
11:00 [Demonstration] ProteomeLab PF2D (Beckman/Hyoung Joo Lee)
13:00 Lunch
14:30 [Lecture 3] 2DE Trouble Shooting (Sang Yun Cho, Ph.D., Hye Young Kim, Researcher)
16:20 [Lab 4] De-casting & Protein Detection (CBB, Deep Purple)
17:30 End
Day 3
Wednesday, Jul 21, 2004
09:00 Coffee & Tea, Refreshment
09:30 [Lab 5] Image capture (Bio-Rad GS-710, Amersham Bioscience TyphoonTM , YSRC) and spot picking
12:00 Lunch
13:45 [Lecture 5] Introduction to Mass Spectrometry (Jong Shin Yoo, Ph.D.)
14:45 [Lecture 6] Tandem-Mass Spectrometry (Jong Shin Yoo, Ph.D.)
15:40 Break
16:00 [Lecture 7] Application of Nano LC-MS/MS system and Spectrum Mill (Agilent)
16:30 [Demonstration] Nano LC-MS/MS system (Agilent/Jun Seok Lee)
17:30 [Lab 6] In-gel Digestion for MALDI Analysis
18:30 End
Day 4
Thursday, Jul 22, 2004
09:00 Coffee & Tea
09:30
PART
[Lab 7] Desalting of peptide mixtures with Poros / Oligo mini-column
[Demonstration] MALDI-TOF/TOF and Q-Star (YSRC)
12:00 [Lecture 8 and Lab 8] Image Convert, Compensation, Spot detection, Spot Pairing and Grouping (IMP5) (Sang Yun Cho, Ph.D.)
13:00 Lunch
14:30 [Lecture 9 and Lab 9] Advanced Image Analysis with Statistical Method I (IMP5) (Sang Yun Cho, Ph.D.)
16:10 [Lecture 9 and Lab 9] Advanced Image Analysis with Statistical Method II (IMP5) (Sang Yun Cho, Ph.D.)
18:00 End
Day 5
Friday, Jul 23, 2004
09:00 Coffee & Tea, Refreshment
09:30 [Lecture 11] Search tips on PMF (Young-Wook Jeon)
10:10 [Lab 11] Practice of MALDI-MASS & DB search
13:00 Lunch / Commencement / Photo
14:30 [Lecture 12] (Young-Ki Paik, Ph.D.)
- Ongoing HUPO Projects (HPPP, HPSI, HBP, HLP, etc)
- Writing-up Manuscripts for the Major Proteomics Journals (“How to write up the manuscript for MCP, Proteomics, JPR, Clinical Proteomics”)
15:30 [Lab 12] Practice of MALDI-MASS & DB Search
18:00 End
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