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31th YPRC/BPRC Proteomics Workshop

작성자
KHUPO
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                       31th YPRC/BPRC Proteomics Workshop

2006 1월 세계인간프로테옴 기구 (HUPO) Education & Training Center (Asia 지역 총괄)로 선정된 연세프로테옴연구센터에서는 제 31차 프로테오믹스 워크샵을 2010 7 5부터 9일까지 5일간 1주일 코스로 진행합니다
 
본 워크샵은 2-DE non 2-DE의 다양한 proteomics 실험기법 및 분석방법 교육뿐 만 아니라, 실제 실험과정에서 겪을 수 있는 문제점의 실무적인 해결책을 제공하는 것에 보다 큰 목적을 두고 있습니다. 샘플의 전처리과정, 2-DE 이미지 분석과정, MS MS/MS 데이터를 이용하여 단백질 동정결과를 얻는 과정에서, 발생 가능한 문제점에 대해 연세프로테옴연구센터의 해결 노하우 등을 제시함으로써, 국내 프로테오믹스 분야의 질적 향상을 꾀하고자 합니다. 또한, Proteomics 등 주요 프로테오믹스 관련 논문의 게재에 필요한 최소 guideline에 대한 대처 방법 등 실질적인 부분에서 해당 분야 연구자들께 도움을 드리고자 합니다.
 
지난 9년간 총 30차에 걸쳐 축적된 교육 노하우를 바탕으로, 10 단계의 실험과정 및 강의가 진행될 예정입니다. Lab 과정에서는 수강자 본인의 샘플에 대한 2-DE 분석 전 과정을 직접 실시하게 되며, 강의과정을 통해서 proteomics분석 방법의 이론적 배경 및 문제점의 해결 방법을 교육받으실 수 있습니다. 2DE 응용분야인 Narrow range 2DEDIGE 분석에 대한 내용을 들으시고, non 2DE 기반 장비들인 LC-MS/MS, LC-MALDI, PF2D, iTRAQ에 대한 소개와 demo 실험을 통해, non 2-DE 기법에 대한 응용 가능성을 미리 검토하시기 바랍니다.
 
2-DE 프로테옴 분석에서 가장 중요한 과정 중의 하나인 2-DE image 분석을 위하여, Melanie 분석 프로그램을 개인별로 할당하여, 직접 프로그램을 사용하면서 결과를 도출할 수 있는 교육을 받으시도록 하였습니다.

심도 있는 Proteome informatics session을 기획하여, MS, MS/MS spectrum PTM 분석 결과를 이해하고, 활용하는 데에 필수적인 다양한 informatics tool에 대한 교육을 실시합니다.

 2010. 5. 17.
연세프로테옴연구센터 (http://www.proteomix.org소장     

워크샵 안내

1) 장소 및 일시 : 연세대학교 산학협동관 3310호 강의실, 4416호 실험실

2010년 75 () ~ 7월 9 (), 5 일간 

2) 장소: 연세대학교 연세프로테옴연구센터 (YPRC)

► 후원: 보건복지가족부 지정 질병유전단백체연구지원센터 (BPRC)  

3) 정원: 15명 이내 

4) 참가비: YPRC, 유전체연구센터 참여 연구원- 110만원, 일반- 130만원 

5) 참가자에게 제공되는 혜택 (사정에 따라 변경 가능)

1. 강의교재 (강의 내용, 실험절차 모음 및 강의용 유인물 자료 등)

2. 본인 샘플 2-DE 분석기회 제공 (1 paired sample)

3. 수료증, 실험가운, USB 메모리 (1 GB)

4. 워크샵 기간 중 중식, 무료 주차

 

6) 강사진
1. 백융기 교수 (HUPO 회장, Senior Editor (Proteomics 저널))

2. 강의와 실험 조교

YPRC/BPRC 연구원- 형주 박사 (LC-MS/MS), 정슬기 박사 (Proteome Informatics),

나근 (2DE, 2-D DIGE), 김혜영/이선희 (Sample preparation, 2-DE),

정안성/최은영 (In-gel digestion & MALDI-TOF)                      

 7) 참가신청요령

첨부한 신청양식을 작성하셔서, 아래의 e-mail 주소로 신청서를 보내주시기 바랍니다.

o 담당자 (나근): nak@proteomix.org (02-2123-6625, 011-316-8264) 
     o 참가비 입금 및 영수증 발급, 샘플 준비 방법: 신청서를 받고 나서 개별 안내합니다.
 
31 Workshop 일정

Day 1

20107 5

9:00

Registration, Coffee & Tea

9:30

[Lecture 1] Introduction to Recent Trends in Proteomics

and Discovery of Biomarker (Prof. Young-Ki Paik)

11:00

[Lab 1] Sample Preparation and Isoelectric focusing (IEF)

12:30

Lunch

14:00

[Lab 2] TCA Precipitation

16:00

[Lab 3] Gel Casting

17:30

End

Day 2

20107 6

8:30

Coffee & Tea

9:00

[Lab 4] Equilibration and 2DE Analysis of Samples

11:00

[Lecture 2, Demo 1] Mass spectrometry Basics and Application

of Nano LC-MS/MS system

12:00

Lunch

13:30

[Lecture 3, Demo 2] ProteomeLab PF2D

15:30

[Lecture 4] 2DE Application : 2-D DIGE

17:00

[Lab 5] De-casting & Protein Detection (CBB)

18:00

End


Day 3

2010 7 7

8:30

Coffee & Tea

9:00

[Lecture 5] 2DE trouble shooting

10:30

[Lecture 6] High throughput protein identification strategy

based on MS/MS analysis

12:00

Lunch

13:30

[Lab 6] Image Capture

15:30

[lecture 7, Lab 7] In-gel Digestion for MALDI Analysis

18:00

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